Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPTEP56180 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPTEP56180 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms