Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRISP1P54107 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms