Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVDP53602 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVDP53602 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MVDP53602 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms