Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSK3BP49841 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms