Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms