Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2IP36954 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms