Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC1P33527 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms