Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRDP23468 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms