Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BGNP21810 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BGNP21810 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BGNP21810 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BGNP21810 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BGNP21810 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BGNP21810 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BGNP21810 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BGNP21810 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BGNP21810 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BGNP21810 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BGNP21810 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BGNP21810 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BGNP21810 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BGNP21810 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BGNP21810 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BGNP21810 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BGNP21810 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BGNP21810 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BGNP21810 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms