Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD247P20963 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD247P20963 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms