Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms