Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms