Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD8BP10966 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD8BP10966 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD8BP10966 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD8BP10966 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD8BP10966 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD8BP10966 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD8BP10966 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms