Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THY1P04216 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THY1P04216 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms