Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C6orf47O95873 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms