Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms