Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLXNC1O60486 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms