Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXO3O43524 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXO3O43524 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms