Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COCHO43405 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COCHO43405 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COCHO43405 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms