Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms