Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms