Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BML4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BML4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BML4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms