Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms