Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms