Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms