Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL33A6NCF5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms