Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SSPOA2VEC9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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