Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms