Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNPO3Q9Y5L0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms