Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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