Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms