Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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USP18Q9UMW8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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