Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms