Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFMBT1Q9UHJ3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms