Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms