Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCF2Q9UG63 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms