Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms