Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC17A6Q9P2U8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms