Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCMF1Q9P0J7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms