Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA13Q9P0J0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms