Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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