Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SNX15Q9NRS6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SNX15Q9NRS6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SNX15Q9NRS6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SNX15Q9NRS6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SNX15Q9NRS6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SNX15Q9NRS6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SNX15Q9NRS6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SNX15Q9NRS6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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