Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms