Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSPNQ9HAW4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms