Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms