Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms