Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms