Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
STAC3Q96MF2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms