Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP53Q96M91 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms