Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms